Publikacje

Robust optimization of SVM hyperparameters in the classification of bioactive compounds. Wojciech M Czarnecki, Sabina Podlewska, Andrzej J Bojarski
Journal of cheminformatics, 10.1186/s13321-015-0088-0
PMID:26273325
Piątek, 14 Sierpnia 2015
Multiple conformational states in retrospective virtual screening - homology models vs. crystal structures: beta-2 adrenergic receptor case study. Stefan Mordalski, Jagna Witek, Sabina Smusz, Krzysztof Rataj, Andrzej J Bojarski
Journal of cheminformatics, 10.1186/s13321-015-0062-x
PMID:25949744
Czwartek, 7 Maja 2015
Multi-Step Protocol for Automatic Evaluation of Docking Results Based on Machine Learning Methods--A Case Study of Serotonin Receptors 5-HT(6) and 5-HT(7). Sabina Smusz, Stefan Mordalski, Jagna Witek, Krzysztof Rataj, Rafał Kafel, Andrzej J Bojarski
Journal of chemical information and modeling, 10.1021/ci500564b
PMID:25806997
Wtorek, 28 Kwietnia 2015
Fingerprint-based consensus virtual screening towards structurally new 5-HT(6)R ligands. Sabina Smusz, Rafał Kurczab, Grzegorz Satała, Andrzej J Bojarski
Bioorganic & medicinal chemistry letters, 10.1016/j.bmcl.2015.03.049 S0960-894X(15)00255-3
PMID:25866241
Czwartek, 23 Kwietnia 2015
Bioisosteric matrices for ligands of serotonin receptors. Dawid Warszycki, Stefan Mordalski, Jakub Staroń, Andrzej J Bojarski
ChemMedChem, 10.1002/cmdc.201402563
PMID:25772514
Poniedziałek, 30 Marca 2015
Exploiting uncertainty measures in compounds activity prediction using support vector machines. Sabina Smusz, Wojciech Marian Czarnecki, Dawid Warszycki, Andrzej J Bojarski
Bioorganic & medicinal chemistry letters,
PMID:25466199
Poniedziałek, 9 Marca 2015
Towards novel 5-HT7versus 5-HT1A receptor ligands among LCAPs with cyclic amino acid amide fragments: design, synthesis, and antidepressant properties. Part II. Vittorio Canale, Rafał Kurczab, Anna Partyka, Grzegorz Satała, Jagna Witek, Magdalena Jastrzębska-Więsek, Maciej Pawłowski, Andrzej J Bojarski, Anna Wesołowska, Paweł Zajdel
European journal of medicinal chemistry, 10.1016/j.ejmech.2014.12.041 S0223-5234(14)01150-7
PMID:25555143
Piątek, 20 Lutego 2015
Generic GPCR residue numbers - aligning topology maps while minding the gaps. Vignir Isberg, Chris de Graaf, Andrea Bortolato, Vadim Cherezov, Vsevolod Katritch, Fiona H Marshall, Stefan Mordalski, Jean-Philippe Pin, Raymond C Stevens, Gerrit Vriend, David E Gloriam
Trends in pharmacological sciences, 10.1016/j.tips.2014.11.001 S0165-6147(14)00192-8
PMID:25541108
Poniedziałek, 5 Stycznia 2015
A new crystal structure fragment-based pharmacophore method for G protein-coupled receptors. Kimberley Fidom, Vignir Isberg, Alexander S Hauser, Stefan Mordalski, Thomas Lehto, Andrzej J Bojarski, David E Gloriam
Methods (San Diego, Calif.), 10.1016/j.ymeth.2014.09.009 S1046-2023(14)00315-6
PMID:25286328
Sobota, 27 Grudnia 2014
Lessons from chlorophylls: modifications of porphyrinoids towards optimized solar energy conversion. Dariusz Karcz, Bożena Boroń, Arkadiusz Matwijczuk, Justyna Furso, Jakub Staroń, Alicja Ratuszna, Leszek Fiedor
Molecules (Basel, Switzerland), 10.3390/molecules191015938
PMID:25286377
Wtorek, 7 Października 2014